BIR登録時に発行されるCOR取得後、必要書類をPEZAに提出 し、PEZA登録書（PEZA Certificate）の申請を行います。申請から PEZA登録書の取得までに、2～3週間かかるのが通常です。PEZA 登録のIT企業の場合、PEZA登録を行う市によっては、地方政府へ の登録を免除されていない場合があるので注意が必要です。この場 合には、通常の現地法人の設立同様に、バランガイの発行するバラ ンガイ・クリアランスや、市役所の発行する営業許可証（Business Permit）の取得が必要になります。これは、PEZAと市が結んでいる 協約の内容が場所よって異なることに起因した現象です。
PEZA登録書の取得手続は以下の流れで進みます。
・ PEZA登録書の申請
・ 登録契約書（Registration Agreement）の発行
・ 登録契約書（Registration Agreement）への現地法人社長の署名
・ PEZA登録書の発行
PEZ登録企業のインセンティブの一つであるPEZAビザは、PEZA登録書取得後に申請が可能となります。
PEZA登録書申請に必要な書類
・ 開発者からの認可書（Letter of No Objection from the Developer）
・ 賃貸人からの認可書（Letter of No Objection from the Lessor）
・ 賃貸借契約書（Lease Contract）
・ 公証済確約書（Notarized Undertaking）
・ SEC登録書のコピー（Copy of SEC Registration）
・ BIR登録書のコピー（Copy of BIR Registration）
・ 登録料支払の証明書（Proof of filing fee）
